Die Geeste entspringt südöstlich von Hipstedt im Landkreis Rotenburg (Wümme) und tritt westlich der Heinschenwalder Brücke erstmals in den Landkreis
Cuxhaven ein und mäandriert bis zur Köhlener Brücke naturnah durch eine reich strukturierte Talniederung.
Westlich der Köhlener Brücke erweitert sich die Talaue und bildet mit den Randmooren eine ausgedehnte Niederung, die heute überwiegend gepoldert ist und meist intensiv als Grünland genutzt wird. Trotz der Bedeichung des Flusslaufes kam es in der Vergangenheit bei höheren Wasserständen regelmäßig zu ausgedehnten Überflutungen in der Niederung.
Teile der Geeste-Niederung stehen mit dem NSG CUX 13 "Geesteniederung" unter Naturschutz. Dieses umfasst den Mittellauf sowie Teile der Oberläufe der Geeste mit ihrer reich strukturierten Flussaue, die Mündungsbereiche der Nebengewässer, den Unterlauf des Frelsdorfer Mühlenbachs mit seiner Flussnierung sowie die meist landwirtschaftlich genutzten oder mit Wald bestandenen Übergänge zur Geest.
